慢性颅骨骨髓炎的确诊通过以下几点：

1.反复发作的局部红肿、疼痛，患者多伴有不规律的发热、全身乏力、饮食差造成消瘦、营养不良甚至贫血。严重的出现皮肤破溃，伴有脓性分泌物排出，短期后皮肤愈合，反复发作，甚至有坏死的骨质排出。

2.颅骨CT检查有骨皮质的变厚、骨皮质厚薄不一样、表面凸凹不平、骨质密度增高、骨皮质表面有大小不等的窦道形成。

3.破溃口或红肿区骨穿刺抽取液体培养有细菌生长。