慢性骨髓炎主要是根据症状体征、病史以及辅助检查来进行确诊。

症状体征主要是表现为局部出现肿胀、疼痛，甚至出现皮肤的破溃、流脓，有可能还会见到死骨从皮肤的窦道中流出，再加上患者可能会出现全身的低热，甚至是高热。如果患者既往曾经患有化脓性骨髓炎或者化脓性关节炎或者局部曾经产生过外伤，都要怀疑产生慢性骨髓炎。

影像学方面会发现局部骨质反复的增生、骨膜反应，同时还会看到孤立性的死骨，一般可以倾向于慢性骨髓炎，同时再进行一些血液生化学检查、骨的ECT检查、血常规检查和血液疾病以及骨肿瘤进行相应的鉴别。