外科口罩之所以能防病毒，主要和它的结构有关。外科口罩共分为三层，外层为阻水层，可阻隔飞溅的液体。中层为过滤层。内层则为吸水层，可吸收佩戴者口鼻的水气。

过滤层是口罩起到防护作用的关键所在。多采用熔喷布作为材料，熔喷布能有效阻隔0.3到1.0pm的微粒。而多数病毒直径在100nm，较大的病毒直径为300~450nm，较小的病毒直径也达到了18～22nm。

由于病毒的直径大大超过了过滤层的间隙，因此外科口罩能够有效的阻挡病毒通过气道进入人体，从而达到防病毒的作用。