尿液检查结晶高的原因跟尿液浓缩有关。草酸盐、尿酸等有形成分过多，即可在尿检时提示结晶过高。常发生于饮水量太少、体液丢失过多导致尿液浓缩，即可出现尿结晶值偏高。

另外，可能的原因是泌尿道泥沙样结石或者是有钙盐沉积，排尿时尿道内的细小结石、钙盐等随尿液排出，化验检查时也可见结晶偏高。

泌尿道患有感染性病变，尿液中的炎性介质等成分增多，是尿结晶高的感染性疾病原因之一。

糖尿病或肾脏本身病变导致肾功慢性受损，影响肾脏的滤过及代谢的功能，也可表现为结晶高。