尿道口取分泌物标本送实验室化验检查，显微镜下标本中可见滴虫，即可诊断滴虫性尿道炎，可给予甲硝唑、替硝唑等药物治疗。

为了改善滴虫感染尿道导致的尿急、尿痛感觉，可口服萘哌地尔、吲哚美辛等对症止痛、解痉。同时可增加饮水量，促使排尿量以及排尿频率增加，排尿过程中有利于滴虫感染形成的炎性分泌物排出，对尿道具有冲洗作用，有利于滴虫性尿道炎症状改善。

由于滴虫可通过性行为导致性伴侣被感染，滴虫性尿道炎未完全治愈的情况下，暂不要安排性生活。