软下疳和生殖器疱疹的区别，在于发病的原因和临床症状以及治疗手段上。

两种疾病虽然都是性传播疾病，但是软下疳主要是由于杜克雷嗜血杆菌感染人体而引发，而生殖器疱疹则是由于单纯疱疹二型病毒感染人体而引发的。

从临床症状角度考虑，软下疳会在生殖器部位出现疼痛性质的溃疡，这种溃疡早期成脓疱，后期脓疱破裂会有脓液出现，而且会导致腹股沟淋巴结出现肿大。而生殖器疱疹则主要会以皮肤生殖器部位出现疼痛性质的小水疱为主，会呈现灼热。如果不治疗会逐渐消退，然后会再一次反复发作。

而从治疗角度，软下疳建议选择抗生素进行治疗，而生殖器疱疹则建议选择使用抗病毒药物进行治疗。