肠炎最常用的确诊方法就是肠镜检查。因为在肠镜检查下可以直观地看到肠黏膜的病变，如水肿、出血、糜烂、溃疡等。但也可以采用病理切片的方式，这样可以准确地明确肠炎类型。

肠炎的检查方法还包括血常规和便常规。通过血常规可以检测中白细胞、中性粒细胞等细胞的异常情况。便常规可以观察是否出现潜血等情况。当然，肠炎的确诊方法还需要结合患者的临床症状，如腹痛、腹胀、腹泻、里急后重等。

经过以上的确诊方法，然后在医生的指导下，经过药敏试验进行针对性的治疗。