囊胚和胚胎的主要区别在于他们是发育的不同阶段。他们的区别在于时间的区别。囊胚是胚胎发育中的一个阶段。从培育的时间和程度上来看，试管婴儿形成的受精卵经过两天到三天的发育，从而形成的这个阶段就叫做胚胎。囊胚的时间主要是培育受精卵到5天或者6天的时候才会形成。所以囊胚和胚胎的形成时间是有区别的。囊胚和胚胎的区别还在于稳定性。胚胎因为形成时间比较短，所以形态结构上还不是很稳定。因为胚胎包含的细胞个数是比较少的。也就是组成的细胞很少。囊胚会相对稳定一些其组成的细胞是很多的，可以达到100多个，所以会相对稳定一些。