以下疾病会引起全身的关节疼痛：

第一，自身免疫性疾病，类风湿性关节炎，其一般多发生于年轻女性，伴有关节部位的晨僵表现，大部分患者类风湿因子呈阳性等。

第二，骨质疏松性病变，一般多发生于绝经区的女性以及老年患者，通过X线片以及骨密度检查可进一步明确诊断。

第三，自身免疫性疾病，强直性脊柱炎可以造成全身的关节疼痛，其大部分患者HLA-B27呈阳性的表现，主要是侵犯全身的髋关节、膝关节、肘关节等大关节。

第四，一些肿瘤性病变以及感染性病变，可以造成全身的关节疼痛。