真菌中毒症治疗的周期取决于患者的用药情况以及个人的临床表现，同时也与患者个人的身体素质有一定关系，大部分患者治疗该疾病所需要的时间都要10~15天。

该疾病主要的治疗方针是给予排毒素治疗，并且结合解毒以及对症支持治疗的方法缓解症状。排毒治疗主要是通过催吐以及导泻剂，在急性期可以通过呕吐以及腹泻来排毒素，有利于症状的缓解，同时也可以使用解毒药物。

但是要注意纠正脱水、电解质紊乱以及酸碱失衡等并发症，具体药物的用法、用量需要在临床医生的指导下应用。