肛瘘的多发人群多见于年龄较大、体质虚弱、糖尿病、结核病、免疫力低下的人群，以及各种胃肠道器质性疾病。

比如肛窦炎、痔疮、直肠息肉、直肠脱垂、肛门乳头状瘤等疾病，都可以直接导致肛门直肠周围间隙感染，形成肛周脓肿，进而形成肛瘘。

肛瘘的发生还见于喜欢进食辛辣、刺激性食物的人群，因工作关系长期久坐久站，负重行走，户外活动时间较少，肥胖的患者，另外喜欢骑行的运动员都是肛瘘的多发人群。