耳朵里面有小洞，可能是下列原因导致：

1.耳内皮肤黏膜的损害。如果使用比较尖利的物品，例如牙签或者是木棍等掏耳朵，有可能造成耳朵皮肤黏膜的扎刺损害，导致局部破溃的位置出现小洞，这种小洞通常会在几天内自行好转。如果出现了炎症感染的情况，可以局部涂抹红霉素软膏等药物治疗。

2.耳内发育的因素。耳内可能由于先天性的发育，而出现一些瘘管类型的物质。瘘管口就会表现出小孔，这种小孔通常会渗出一定量的分泌物。