要想对于一种疾病进行预防首先需要知道它的病因。甲状舌管囊肿是由于在胚胎时期，甲状腺形成的过程中，甲状舌管退化不全，管腔内的上皮细胞不断的产生分泌物而形成的。所以说甲状舌管囊肿，它是一种先天性疾病是没有办法进行预防的。而甲状舌管瘘是继发于甲状舌管囊肿感染而形成的，因为囊肿可以经过舌盲孔和口腔相通，从而发生感染。说到感染这个问题，就可以进行一定的预防，但是我们不能够保证口腔周围的环境无时无刻保持洁净，所以对于甲状舌管瘘这种疾病，最好的预防措施，就是进行手术治疗，就是如果当我们发现有甲状舌管囊肿的时候，就直接进行手术切除囊肿，避免囊肿继发感染从而形成瘘管。