乙肝小三阳的转阴分为治疗转阴和自然转阴。治疗过程中，应该评估患者的病情。如果是急性乙肝，不管是小三阳的病毒转阴还是乙肝表面抗原转阴都是比较容易实现的，特别是成年感染乙肝而发生的急性肝炎，是可以通过保肝(使用甘草酸制剂)、抗病毒(使用核苷类抗病毒药)治疗而治愈的，而且有些轻症患者可以自愈。而慢性乙肝小三阳病毒转阴，可以通过在恰当的时机抗病毒(使用核苷类抗病毒药)治疗而实现，乙肝表面抗原的转阴，在慢性乙肝小三阳患者中是非常难以实现的，因为慢性乙肝很难治愈。