盆腔囊肿和卵巢囊肿的区别，那就是检查到的盆腔里囊肿，有的并不能很明确囊肿发源的具体部位。

如果明确是在卵巢上就可以做卵巢囊肿的诊断，但是也有的囊肿不能明确是否是卵巢囊肿，而有可能是输卵管肿物，或者是输卵管系膜囊肿，或者是其他的盆腔肿瘤问题，那也就是要先诊断盆腔囊肿的，需要在以后做手术后，才可以明确囊肿的具体来源具体部位。

尤其是在得到病理检查结果明确后，才可以做最后的诊断，才可以最后明确囊肿的性质的，治疗后也要复查。