从以下几个方面治疗肺真菌病，使用一些抗真菌的药物，如氟康唑、伏立康唑积极的抗真菌治疗。

另一方面，要提高身体的抵抗能力，增加营养，进食一些富含蛋白质的食物，身体抵抗力增强了，疾病才会好转的更快，避免受凉，注意保暖。

如果合并细菌感染是要根据痰培养药敏的结果，积极的抗炎抗感染治疗。出现胸闷气喘，要使用平喘的药物出现缺氧时，要给予患者吸氧。有时候会出现咯血，少量咯血，给予补液止血处理，如果出现大咯血，要给予输血，有时候要进行支气管动脉栓塞术，甚至手术来进行止血处理。