直肠粘膜管状瘤可以通过手术的方式将其切除，在术后根据其病理进行下一步治疗。

直肠粘膜管状瘤通常属于直肠息肉，是肠道异常增生的组织，有一定的几率会发生癌变，所以可以通过内镜下完成腺瘤切除手术。在手术的过程中应当尽可能的大面积切除，并且需要在术后将切除组织进行病理检查，明确是否存在恶变。多数患者在切除后预后比较好，如果存在恶变，还需要根据实际情况决定是否要进行放疗或者化疗等一些治疗。

该疾病存在一定的复发率，所以在手术后还需要定期进行肠镜检查。