导致男性不育的先天性疾病，有以下几大类，

第一，阴茎先天性发育异常，如隐匿阴茎，无阴茎，小阴茎，异位阴茎等。

第二，尿道先天性发育异常，如尿道下裂，尿道上裂，先天性尿道憩室，狭窄等。

第三，睾丸先天性发育异常，如无睾，隐睾，异位睾丸等。

第四，其他先天性生殖系统发育异常，如先天性附睾及输精管梗阻，精囊发育不全或缺如，前列腺发育不良或憩室等造成的附属性腺功能障碍。