睾丸扭转后引起的相关并发症，除了与睾丸扭转的程度有关外，还和扭转后引起睾丸缺血的时间有着重要关系。当睾丸扭转的时间超过四小时时，睾丸已经发生了小部分的萎缩。

如果睾丸扭转的时间超过10小时，大部分的睾丸发生明显的萎缩，除非扭转度数小于360度。如果睾丸扭转的时间超过了24小时，睾丸基本已经缺血坏死，将发生比较严重的萎缩。

睾丸扭转即使在即使手术之后，仍然会有睾丸发生萎缩的几率。并且部分患者睾丸及时获救也可以发生继发性萎缩，精子生成不正常等一系列并发症。