贲门癌二期并不是贲门癌的晚期，而属于贲门癌的中期阶段。按照临床上通用的国际TNM的分期标准，二期的贲门癌指的是肿瘤侵犯到固有肌层、黏膜肌层或者黏膜下层。或者侵犯到固有肌层，同时会伴有1~2个区域淋巴结转移的情况。

同时，二期的贲门癌也可以指肿瘤穿透浆膜下结缔组织，而没有侵犯脏层腹膜或者邻近结构，或者肿瘤侵犯脏层腹膜或者邻近结构，但同时并不伴有淋巴结转移的情况。

二期的贲门癌跟晚期贲门癌相比，在治疗和预后方面不同。一部分二期贲门癌可以获得根治性手术切除机会。