临床上把女性在月经前后及月经期发生的头痛为经期头痛，临床研究表明可能于血清中的雌醇浓度变化有关，由于女性的生理特点，在月经前后，血清中的雌二醇浓度降低，引起颅内外血管及子宫血管对某些因素，如五羟酸氨等物质更敏感，从而引起血管张力的变化，使一部分对此敏感的患者发生头痛。

月经后血清中雌二醇浓度恢复至正常，病人的头痛立刻缓解，还有一种，是雌激素通过刺激泌乳素分泌，进而直接和间接的刺激前列腺素分泌，而前列腺素作用于血管引起血管的收缩和扩张，这种变化由于雌激素的影响也呈周期性的变化，从而激发头痛的发作。