肛门流水很臭，首先就是要考虑是有肛瘘的存在。肛瘘一般是在肛门口皮肤的位置有溃口的形成，溃口会有条索样的管道通向肛内，溃口会反复地流脓和流水，会导致肛门局部的异味。并且，会刺激肛门局部出现潮湿、瘙痒等临床症状，在急性发作期再次有感染的情况，还会出现局部的红肿和疼痛。

可以通过肛门局部的望诊，肛门的指检、肛门镜的检查进行初步诊断，必要时可以进行肛周核磁共振的检查，或者是直肠内超声的检查。在诊断明确以后，建议患者及早地进行手术的治疗，术后按时换药，促进伤口的愈合。

另外，肛门流水很臭，也要考虑痔疮等因素的影响。痔疮会导致肛门口的闭合不严，也会导致肠液的外溢，并且会产生很臭的味道。