肛门流黄水有腥臭味，考虑患者可能患有肛周脓肿或者肛瘘病变。这两种病变都是肛肠科常见的感染性病变，由于各种原因导致局部组织发生感染，从而形成脓肿，当脓肿破溃以后，容易诱发肛瘘病变，从而出现流黄水有腥臭味的临床症状。

患者就医检查后，结合患者病史、肛诊、肛周B超，以及肛门镜等检查项目，可以对上述病情进行分析确诊，结合患者当前症状，建议及早手术治疗。通过手术将脓液清除干净，同时将肛瘘瘘管切除或者进行切开引流。

手术后，积极使用抗生素药物抗炎治疗，控制和稳定炎症，避免病变进一步发展。同时手术后要注意复查，注意创面清洁，确保患者伤口从内部向外部愈合，防止假性愈合情况发生。