肛门流黄水、有腥臭味，使用的药物需要结合疾病的诊断，常见的原因有以下几个：

第一，痔疮。痔疮会导致肛门周围渗出增多，内痔反复的脱出也会导致直肠内的黏液以及粪水渗出到肛门周围而引发流黄水的症状，可以使用痔疮栓塞肛门或者外用痔疮膏。

第二，肛瘘。肛瘘会导致肛门周围反复地流脓，也会引发肛门流黄水的症状，可以使用抗生素控制肛瘘的感染，但最终需要通过手术治疗才能完全治愈。

第三，直肠脱垂。直肠脱垂也会导致直肠内的粪水流出而引发流黄水的症状，也需要手术治疗。

患者平时还需要注意肛门局部清洁卫生，每次便后或者睡前使用温水清洁肛门，勤换内衣裤，并保持肛门部干燥。