阿米卡星可用于治疗肠炎，比如大肠杆菌所致的急性肠炎，可以使用这个药物治疗。不过阿米卡星相对副作用还是比较多，所以在用于治疗肠炎疾病时，一定要明确适应证。

阿米卡星具有一定的肾毒性，如果有肾功能不全者，应慎用。还有哺乳期女性使用这个药物，需要暂停哺乳，本品可透过胎盘，有可能会导致胎儿听力发育受损，孕妇不宜使用。

另外，使用这个药物治疗肠炎期间，要适量多饮水。因为急性肠炎易造成体内流失水分，要避免失水而导致血药浓度增高，容易引起毒性反应。