肛门剧烈疼痛是肛周脓肿最主要的症状，所以肛门剧烈疼痛有可能是肛周脓肿。肛周脓肿可大致分为高位脓肿以及低位脓肿，其中低位脓肿主要表现为肛门周围剧烈的疼痛。

之所以疼痛明显，是因为肛门周围神经分布非常丰富，患者会坐卧不安、夜不能寐。肛周脓肿局部表现为红肿、疼痛的硬块，脓肿成熟者会伴有明显的波动感。

而高位脓肿由于是受植物神经支配，所以疼痛感可能并不明显。但是患者会表现严重的频繁便意、里急后重以及肛门坠胀，有些会伴有发热、畏寒、寒颤等全身症状。