卵巢囊肿术后有可能会复发。

首先要看卵巢囊肿的类型，对一些单纯的卵巢良性囊肿，一般剥除之后该囊肿本身是不会复发。但是卵巢表面其他的部位也可能重新长出卵巢囊肿，或者一些恶性的，或者交界性的卵巢囊肿，术后很多也是会存在复发。最容易复发的就是卵巢巧克力囊肿，其复发率是非常高的，因为卵巢巧克力囊肿是有活力的子宫内膜异位到卵巢上而形成，跟体内的雌激素水平有关。

所以为了预防卵巢巧克力囊肿术后复发，往往在术后会进行药物治疗。其目的是为了抑制子宫内膜生长，从而起到人工绝经的作用，这样就可以有效地预防卵巢囊肿术后复发。