鹅口疮治疗过程中是可以吃益生菌的，益生菌可以纠正肠道内菌群失调，抑制真菌生长。但是除了口服益生菌治疗以外，建议使用2%碳酸氢钠溶液于进食前后清洁口腔，或者局部涂抹10万~20万U/ml制霉菌素鱼肝油混悬溶液，每天2~3次，或遵医嘱涂抹。

平时要注意哺乳卫生，注意餐具及玩具卫生，避免接触真菌感染鹅口疮。还要加强营养，提高患儿免疫力，避免患儿反复感染，长时间使用抗生素诱发此病。

此外，还可以适当增加维生素B2和维生素C的摄入，以提高口腔黏膜抵抗力。