直肠窝积液的治疗方法需要结合引发积液的原因。

如果直肠窝积液不伴有任何的症状，而且积液量非常少，属于生理性积液，并不需要治疗。因为人正常腹腔内会有少量的液体润滑肠道、腹膜、腹壁等。

而如果直肠窝积液是由于某些疾病所导致，其治疗方法需要根据原发疾病来决定。例如女性盆腔炎会导致直肠窝积液，在积液的同时会伴有腹部疼痛症状，主要因为盆腔感染所引发，所以需要使用抗生素控制局部感染，必要时可以通过阴道后穹窿穿刺引流。也有可能是因为心脏、肝脏或者肾脏等疾病所引发的积液，需要积极治疗原发性疾病，才能消除直肠窝积液。