咽拭子采集时检查者有可能出现干呕或是呕吐的情况，取完样本以后会逐渐缓解，一般是不需要特殊处理的。

如在痰及咽拭子分泌物中检测出致病菌，则视为呼吸道感染，可以结合影像学检查确定感染的部位，如果培养出细菌感染，需要及时使用抗菌素治疗，可以指导临床用药。

取样本时最好是在使用药物之前采集标本，避免影响检查的结果，检查咽拭子不受吃饭的影响，随时是可以检查的。检查前需要用清水漱口，使用长棉签采集咽喉深部的分泌物，棉签取出之前不要碰触口腔的其它部位。