脑囊虫发病率通常并不大。脑囊虫一旦引起神经系统感染，往往好发于脑皮层以及脑实质，易引起头疼、呕吐、癫痫等症状。脑囊虫发病率不大的原因与以下因素有关：

1.目前随着生活环境的改善，老百姓生活习惯的养成，如饭前洗手、不吃生冷食物等，切断了脑囊虫病的传播途径。

2.脑囊虫病通常存在自身感染和外源性感染的途径，但是自身的感染是主要的传播途径，通常不会引起人与人之间的传播，因此脑囊虫病发病率会大大地降低。

3.脑囊虫病发病后可以通过吡喹酮进行治疗，往往疗效较好、治愈率高，因此大大地降低了其发病率。