脑囊虫病一般通过积极、规范化治疗，大多数患者不会复发，但也有部分患者可能存在再次感染的情况而导致复发。

临床上也可能存在一些特殊的情况，比如脑囊虫病患者没有得到彻底治疗，体内仍旧存在没有被彻底杀灭的寄生虫，当残留在体内的虫卵重新孵化出脑囊虫，则会继续对人体造成侵害，而导致脑囊虫病复发。

因此，针对脑囊虫病一定要到正规医院进行规范、合理的治疗，即使疾病痊愈也应遵医嘱继续服用一段时间的药物，将脑囊虫病彻底治愈。同时，应注意避免吃生肉、生菜，防止出现再次感染复发。