直肠肛管疾病的治疗方式包括有药物治疗和手术治疗。

直肠肛管疾病包括痔疮、肛裂、直肠肛管周围脓肿、肛瘘。早期的痔疮可以通过肛门内塞痔疮栓和中药坐浴进行药物保守治疗，对于反复发作，二期以上的痔疮，可通过手术切除。初发的肛裂可通过中药坐浴和裂口部位涂抹痔疮膏，促进伤口愈合，陈旧性的肛裂就是做手术。

直肠肛管周围脓肿，一旦发现需要做手术切开，进行排脓，术后抗生素抗炎治疗。肛瘘一旦形成后，也需要做手术将外口和瘘管一并切除，才能治愈。