肛门手术的炎症如果很严重，导致肛管皮肤坏死、脱落，有可能发生肛门狭窄。因为肛管的皮肤延展性很差，而且是不能再生的。所以肛门手术后，要给予预防性或治疗性的抗菌药物输注，以防发生炎症。

尤其在治疗肛周脓肿、肛瘘等感染性疾病时，术中一定要注意，将脓腔、瘘管及内口处理好，彻底清除坏死物组织及脓液，最好取少量的脓液及坏死组织送细菌培养，并进行药物敏感实验，待结果出来后，就能挑选对治致病细菌敏感的抗菌药物使用，从而取得比较好的抗感染效果。