包虫病是不能够进行术前囊肿穿刺进行确诊的。因为包虫病如果穿刺后，棘球蚴破溃到了腹腔，胸腔中会发生弥漫性腹膜炎、胸膜炎、过敏性反应。严重时会引起患者出现过敏性休克而危及生命。

另外，因为脓液中的头节可以播散到腹腔或者是胸腔中引起继发性的棘球蚴病。

包虫病的确诊可以采用影像学检查，在B超检查上可以看见明确的囊状的液性暗区。其间可见散在的光点或小光圈。CT检查对于肝、肺、脑、肾包虫病有着重要的诊断意义。