宝宝晚上睡觉摇头可能为以下原因所引起：

1.佝偻病。主要是由于宝宝体内缺乏钙和维生素D所引起，会使宝宝出现睡觉摇头、哭闹不止、睡眠不安等症状。在确诊以后，应当通过饮食或者是药物补充维生素D和钙质，也要多带宝宝外出晒太阳。

2.湿疹。如果宝宝存在过敏体质，对一些物质出现了过敏反应，就会导致宝宝颈部、颜面部等部位出现瘙痒，在晚上时就会通过摇头的方式改善瘙痒的症状。

3.耳朵异常。如果宝宝外耳道出现湿疹或者是耳朵内的耵聍过多，可能会导致宝宝耳朵不舒服，就会通过摇头的方式缓解。