导致宝宝晚上摇头、哭闹的原因如下：

1.如果宝宝存在过敏体质，会使颈部、颜面部等部位出现湿疹。在晚上睡觉时，瘙痒的症状可能会加重，孩子就会出现摇头、哭闹的症状。

2.如果宝宝体内钙剂以及维生素D过度缺乏，可能会引起佝偻病，就会导致宝宝在夜间啼哭、摇头、汗多、枕秃等症状，也会对宝宝的身体发育造成不良影响，应及时进行调理。

3.如果宝宝存在过敏性的鼻炎等，可能会导致鼻塞、鼻痒、流鼻涕等症状，会使宝宝感觉到很不舒服，就会出现晚上摇头、哭闹的现象。