秋季早上起床喉咙疼，可能与急性咽喉炎有关，疼痛症状比较明显，而且起病比较急。

慢性咽炎也会出现这种症状，同时还有可能会伴随咽部异物感。扁桃体炎也有可能会在早上起床后，出现喉咙疼痛的症状。此外，由于秋季空气比较干燥，特别是在夜间，室内空气湿度不够，加上夜间张口呼吸，也有可能会引起起床后喉咙疼痛的症状。

除此之外，这种情况也有可能与胃食道反流性咽喉炎有关。夜间在睡眠过程中，胃内容物会发生反流的现象，咽喉部位受到胃酸的刺激，可能会导致咽喉部黏膜炎症，所以早上起床后出现喉咙疼痛。