主肺动脉间隔缺损是否能够注射新冠疫苗，需要根据缺损的范围大小来判断。

如果缺损的范围比较小，血液的分流量不大，这种情况下血流动力学基本稳定，患者没有不适的症状。因此，可以注射新冠疫苗。因为患者比较容易感染新冠肺炎，一旦感染以后，对心脏和肺部的功能影响非常大。会对患者造成生命危险，所以及时注射新冠疫苗可以预防肺炎的发生。

反之，如果主肺动脉间隔缺损非常大，血液的分流量比较大，这样会造成患者肺淤血、肺动脉高压以及身体缺氧。这种情况下，患者病情不稳定，不适合注射新冠疫苗，以免发生不良反应。最好先对疾病进行治疗，通过介入治疗或者手术治疗，将缺损封堵或者修补，然后再接种新冠疫苗比较安全。