呼吸困难不能自主呼吸是有危险的，因为这时候患者不能够进行自主的呼吸，会造成患者的窒息，危及患者的生命。

出现这种情况的时候，需要及时地到ICU或者请麻醉科医师进行气管插管或者气管切开，连接呼吸机辅助呼吸。这种情况大多数见于重症感染，或者严重的心脑血管疾病，以及多器官功能衰竭患者。

对于这类患者需要积极地进行抗感染治疗，并且恢复多脏器的功能，治疗心脑血管疾病。患者在出现不能自主呼吸的时候，需要积极地进行处理，不要延误，防止危及患者的生命。