孕妇头疼是脑炎的可能性比较小，更大的可能是血管神经性的头痛、神经衰弱、植物神经功能紊乱所导致的。

脑炎是颅内的大脑组织被细菌、病毒、结核杆菌或者真菌等微生物感染，所导致的严重疾病。脑炎除头痛之外，还可能出现发热、恶心、呕吐、肢体瘫痪、感觉异常、智力下降、性格和行为的改变等症状。

如果只是单纯头疼，脑炎的可能性比较小。孕妇由于处于特殊的生理时期，更大的可能是因为休息不好、精神压力过大，从而导致血管神经性的头痛。

在怀孕的时期不适合做头颅的CT检查或者脑脊液的穿刺化验，可以到医院的神经内科就诊，在医生的指导下选择一些合适的检查项目明确头疼的原因。