摩根菌肺炎是由于细菌感染导致的，它是由于摩根菌感染引起，而摩根菌又属于肠杆菌，是细菌的一种类型，摩根菌也是医院感染性肺炎比较常见的致病菌。

摩根菌跟大肠埃希菌比较类似，是一种存在条件的致病菌，在人体的肠道中一般不会导致感染、发病，而离开肠道以后就可以导致其他的感染。

例如进入肺部可以导致摩根菌肺炎，而且导致其发病的原因还根据病原体的毒性、个人的免疫力、个人体质等多方面的因素有关系。