附睾炎可以引起睾丸梗死、脓肿形成等并发症，从而影响精子生成。

睾丸梗死和脓肿形成，是急性附睾炎最严重的并发症，由于治疗不及时或者治疗不当，很容易诱发脓肿形成。精索血管血栓形成或者其他原因，会导致睾丸缺血性坏死，从而影响精子的生成。在临床上大约30%的附睾炎患者，其血清中发现抗精子抗体，这也是导致男性不育的主要原因。

所以一旦明确为附睾炎，要及时、规律地应用抗生素。如果长期应用抗生素无效后，附睾切除术是作为缓解症状的最后手段。