甲状腺穿刺活检最主要的危害就是穿刺的部位会出现疼痛的症状。其次，穿刺部位会伴有出血的症状，如果护理不当会引起感染。

甲状腺穿刺活检后的危害与医护人员是否操作得当和患者的配合度也有关，所以做穿刺一定要到专业的医院，同时积极配合医生，以减少穿刺产生的危害。

甲状腺穿刺后对细胞进行活检，对于初步诊断甲状腺结节的性质，意义是很大的，对于下一步的治疗也起到决定性的作用。一般是在彩超状态下发现结节过大、血流以及边界的状态趋于恶性，并且甲功也异常时，需要经活检来诊断。