早上醒来两肋胀痛主要有以下方面的原因：

1.可能是睡觉姿势不正及受凉引起，局部的组织受到了压迫或者受凉以后，会释放一些乳酸类的物质，并且局部的血液循环不通畅，就会引起疼痛的症状，尤其在呼吸时会有明显地加重。

2.可能与心脏或者肺部的疾病有关，如果存在着冠心病以及肺部的炎症，在早晨醒来后，也会表现为胸肋部的胀痛不适。

出现这种胀痛以后要及时给予心电图、胸部的拍片检查排除心肺的器质性病变。如果为单纯地受凉引起，可以热敷理疗。另外，也可以外用一些活血化瘀的药物，疼痛的症状会得到有效改善和缓解。