确诊卵巢巧克力囊肿是否可以治好，需要看具体的手术方式。如果是采取的是卵巢囊肿剥除术，术后复发率比较高，复发率40%左右。如果卵巢囊肿小于4厘米，可以进行观察。

如果卵巢囊肿大于4厘米，建议手术治疗。如果患者比较年轻，有生育要求，一般选择卵巢囊肿剥除术，术后应尽早怀孕或者是使用药物减少复发。如果患者无生育要求，可以做患侧附件切除手术，这种手术方式术后复发率为5%左右。

如果是采取的是根治性手术，手术后如果不用雌激素补充治疗，几乎不复发，这种情况主要适用于45岁以上的重症患者。