对于真菌性尿路感染主要是同其他尿路感染引起的疾病所鉴别，一般有两方面，一是普通细菌引起的尿路感染，二是结核导致的尿路感染。因为上述三类疾病都会导致患者出现尿频、尿急、尿痛等尿路刺激症状以及患者可能会出现血尿，主要鉴别是通过实验室检查尿常规、尿培养，如果在尿培养当中明确有细菌，那么证实是细菌性尿路感染，需要使用抗菌药物来进行对症治疗，如果是真菌，那么需要使用抗真菌药物，如果在尿培养当中，明确有结核分支杆菌，那么需要进行抗结核药物对症治疗。