首先应该和细菌性的尿路感染进行鉴别。细菌性的尿路感染，尿细菌培养为阳性。尿真菌培养为阴性，泌尿系统的结石，泌尿系统结石影像学检查。可见结石影真菌性的尿路感染是由致病菌经血行播散或上行感染所致的。真菌性的尿道炎的致病菌，以念珠菌多见。主要为白色念珠菌、尚有光滑念珠菌、热带念珠菌、平滑念珠菌和其他真菌导致的原发性的感染，称为地方性的感染。常见致病菌有组织细胞治军。血型播散播散性的念珠菌并可累及尿路发生念珠菌性的。或者肾盂肾炎肾脏播散性的感染，免疫抑制患者。播散性的隐球菌感染，上行感染潜伏于肠道生殖道的念珠菌侵入并感染下尿路，经膀胱输尿管上行侵入肾脏。长期大量应用广谱抗生素，引起菌群紊乱者。慢性严重疾病糖皮质激素免疫抑制剂。细胞毒性的药物的应用以及肿瘤患者接受放疗及化学治疗，导致机体防御功能降低。

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