阴茎早上小便有刺痛感。有可能男性患有尿道炎或者是前列腺炎。当有尿道炎时尿道口会有一些少许的分泌物，同时解小便时会有刺痛感，如果出现这种情况，男性可以到医院去查个尿常规，看有没有白细胞，如果有白细胞可能是尿道炎症。如果男性有不洁性生活史。晨起有分泌物、有刺痛感，那么我们就需要排除是不是有支原体或者衣原体感染而引起的非淋菌性尿道炎。如果是这种情况，那么我们可以针对性进行治疗。当查尿常规检查是正常，男性依然早上起来小便有刺痛感，这需要排除有没有前列腺炎？有时前列腺炎会导致男性早晨起来小便有刺痛感。查前列腺炎的话，可以查尿液中前列腺小体外泄蛋白，如果这项指标高，那么就有可能是前列腺炎是前列腺炎可以针对前列腺炎进行系统正规的治疗。