鼻胃镜和口胃镜两者检查都各有弊端。

鼻胃镜是将器材从鼻孔插入，不使用从口腔插入，从而可以有效的减轻患者的痛苦，是一种比较新型的胃镜技术，使用鼻胃镜可以有效的帮助减少普通胃镜给患者带来的呕吐、胀气、产生恐惧感，口胃镜主要是通过一条直径0.6到0.9厘米的黑色塑胶包裹的，导光纤维的细长镜身，镜身前端装有内视镜，在内镜下直接观察消化道的疾病问题，比起鼻胃镜可能会有一点不适感。

但是一般最好选择口胃镜，目前鼻胃镜还不能选择麻醉，风险也较大，没有口胃镜的技术成熟，所以目前很多医院都没有常规做鼻胃镜，所以最好使用口胃镜来进行观察。